تعتبر أهداف مركز ابن سينا للتعليم الالكتروني هي جزء من أهداف برامج اليونسكو في مجال العلوم والتعليم العالي وتدريب المعلمين والتعليم والتدريب المهني والتقني.
يهدف المركز إلى تنمية القدرات الجديدة في مجال:
المنهجيات والوسائل التربوية الحديثة وكذلك توظيف التكنولوجيا لأغراض التعليم ومراقبة الجودة.
تحديد الجوانب القانونية ذات الصلة في تطوير المواد الالكترونية
بالطبع سوف تساهم هذه الأدوات في تحسين نوعية نظام التعليم بشكل عام في العراق وكذلك تمكين أصحاب الاختصاص من تطوير وتبادل المواد التعليمية باستخدام تكنولوجيا المعلومات والاتصالات ومفاهيم التعليم الافتراضي.
تكمن الأهداف الرئيسية لمركز ابن سينا للتعليم الالكتروني في:
بناء قدرات التدريسيين في مجال هندسة تطوير المواد الالكترونية.
إنتاج مواد الكترونية عالية ألجوده وقابله للاستعمال على الانترنيت.
بناء مكتبة ابن سينا الافتراضية والتي تضم المواد التعليمية.