تتمثل الرسالة الأساسية لمركز ابن سينا للتعليم الالكتروني بتطوير مهارات التعلم لدى الطلبة لضمان حصولهم على معايير أكاديمية متميزة وإتاحة الفرص لتوظيف واستخدام التقنية في العملية عبر طرح نموذج تعليم ذاتي باستخدام الوسائط التقنية الجديدة لجعل المتعلم مركزا للعملية التربوية وخلق بيئة إبداع أكاديمي لتحقيق جودة التعليم.